先日、USBメモリをさしたまま、OSの再インストールをしていると誤って、USBメモリの中のパーティションも削除してしまいました。
そのままだとUSBメモリが使えなくなってしまったので、以下の方法でフォーマットしました。
コントロールパネル ＞ 管理ツール ＞ コンピュータの管理 ＞ ディスクの管理
右下に表示されるディスクの一覧から該当するUSBメモリを探し、右クリック、（パーティションがある場合は、パーティションの削除後）＞パーシション作成
FAT32でフォーマットしたら、通常通り使えるようになりました。
参考サイト：http://pasokoma.jp/46/lg460187